Pthon批量處理將pdb文件生成dssp文件

# -*- coding: utf-8 -*-
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Created on Sat Jun 20 19:36:34 2015

@author: chaofn
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import os

"""
這個(gè)程序的目的是將linux下/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb目錄中的所有文件（一共有215個(gè)文件）
批處理
將pdb文件生成dssp文件

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#listdir返回文件名的列表
fileLine=os.listdir('/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb')
#遍歷整個(gè)列表
for i in range(len(fileLine)-1):
 #將字符串用變量表示
 input_file='/ifs/home/fanchao/Manesh_pdb/'+fileLine[i]
 #先去掉文件名的后綴，然后形成后綴為dssp的文件名
 out_file=fileLine[i].split('.')[0]+'.dssp'
 output_file='/ifs/home/fanchao/Manesh_dssp/'+out_file
 #注意：參數(shù)的傳遞（先是%s，然后是%變量名），多個(gè)變量的傳入要用元組表示，在元組前用%
 os.system('/ifs/share/lib/dssp/dssp2 -i %s -o %s' %(input_file,output_file))